El máximo campeón de la Liga Expansión MX, según el palmarés histórico, no es un solo club que lo ejerza, sino varios equipos que han ganado títulos. Entre ellos destacan a Irapuato y Piratas FC, aunque el segundo ya dejó de competir en esta división después de ascender a la Liga MX y así su caso fue retirado por la Liga de Expansión.